生物学杂志

生物学杂志 ›› 2025, Vol. 42 ›› Issue (5): 111-.doi: 10.3969/j.issn.2095-1736.2025.05.111

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分析超速离心-沉降速率法研究蛋白质-蛋白质相互作用

常　卿1,2,3， 褚文丹1,2， 芦亚菲1,2， 杨　姊1,2， 曲　娜4， 李文奇1,2,3   

  1. 1. 清华大学 蛋白质研究技术中心， 北京 100084； 2. 清华大学 生命科学学院， 北京 100084；
    3. 清华大学 北京生物结构前沿研究中心， 北京 100084； 4. 石家庄科技职业学院， 石家庄 052165
  • 出版日期:2025-10-18 发布日期:2025-10-14
  • 通讯作者: 李文奇，博士，高级工程师，研究方向为蛋白质制备与鉴定、相互作用分析，E-mail：liwenqi@mail.tsinghua.edu.cn
  • 作者简介:常卿，博士，高级工程师，研究方向为蛋白质制备与鉴定、相互作用分析，E-mail：changqing@tsinghua.edu.cn
  • 基金资助:
    北京生物结构前沿研究中心资助项目（997019045）

Analysis of protein-protein interaction by sedimentation velocity analytical ultracentrifugation

CHANG Qing1,2,3, CHU Wendan1,2, LU Yafei1,2, YANG Zi1,2, QU Na4, LI Wenqi1,2,3   

  1. 1. Technology Center for Protein Sciences, Tsinghua University, Beijing 100084, China;
    2. School of Life Sciences, Tsinghua University, Beijing 100084, China;
    3. Beijing Frontier Research Center for Biological Structure, Tsinghua University, Beijing 100084, China;
    4. Shijiazhuang Vocational College of Science and Technology, Shijiazhuang 052165, China
  • Online:2025-10-18 Published:2025-10-14

摘要： 分析超速离心-沉降速率法（AUC-SV）是一种用于确定溶液中分子大小和形状的经典生物物理技术，可以根据分子之间在相互作用过程中形成的复合物的数量、大小、化学计量学和亲和力来描述它们之间的相互作用。通过AUC-SV建立免疫相关的重要标记分子免疫球蛋白Fc区受体IIb（CD32b）和人IgG1抗体的Fc之间的受体和配体相互作用分析的方法，并与表面等离子共振（SPR）技术和微量热泳动（MST）技术等体外相互作用分析方法进行平行比较，进一步验证了SV-AUC研究蛋白质-蛋白质相互作用的方法可靠性。

关键词: 分析超速离心-沉降速率法, 蛋白质-蛋白质相互作用, 免疫球蛋白Fc区受体IIb, 抗体Fc片段

Abstract: The sedimentation velocity analytical ultracentrifugation （AUC-SV） is a classical biophysical technique for determining the size and shape of molecules in solution, enabling characterization of molecular interactions with regard to the number, size, stoichiometry, and affinity of complexes formed in association processes. A method for the analysis of receptor and ligand interactions between CD32b, an important immune marker molecule, and Fc fragment of Human IgG1 antibody, was established by AUC-SV. Parallel experiments were conducted alongside classical methods for protein-protein interaction （PPI） analysis, such as surface plasmon resonance （SPR） and micro-scale thermophoresis （MST）. The reliability of the SV-AUC methodology for the analysis of PPI was further validated.

Key words: AUC-SV, PPI, CD32b, Fc

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