篮子鱼属线粒体基因组序列系统发育信息分析
- 1. 中国水产科学研究院 南海水产研究所 深圳试验基地， 深圳 518121;2. 中国水产科学研究院 南海水产研究所 农业部南海渔业资源开发利用重点实验室， 广州 510300
Phylogenetic information analysis of mitochondrial genome sequences in Siganus (Perciformes: Siganidae)
- 1. Shenzhen Base of South China Sea Fisheries Research Institute， Chinese Academy of Fishery Sciences，Shenzhen 518121; 2. Key Laboratory of South China Sea Fishery Research Exploitation & Utilization，Ministry of Agriculture， South China Sea Fisheries Research Institute， Chinese Academy of Fishery Sciences， Guangzhou 510300, China
摘要： 分析了6条篮子鱼的mtDNA全序列，揭示了篮子鱼mtDNA的基本结构、变异位点、基因选择压力及系统进化等信息。结果表明：1)篮子鱼mtDNA由37个基因组成，其中ND3基因的变异位点比例最高(22.77%)，比例最小为12S rRNA(4.01%)；2)mtDNA蛋白编码基因（13个）的Ka/Ks均远小于1，且Tajima′s D=0.123 74～0.615 14（P＞0.10）均不显著大于或小于0，表明篮子鱼mtDNA蛋白编码基因进化过程中均受到的稳定性(负)选择作用较强；3)系统进化分析表明，尖嘴篮子鱼与狐篮子鱼最先聚成一支，再依次与眼带篮子鱼和点篮子鱼聚类，之后与褐篮子鱼和长鳍篮子鱼聚成的一支聚类，这种进化顺序与各篮子鱼体色变化一致；4)COX1、ND4和Cytb基因是篮子鱼属内种间系统进化的理想分子标记。