摘要:
探讨了鹿科6属动物主要组织相容性复合体dra(mhc-dra)第二外显子的变异特点,揭示其分子水平上的进化选择模式,并与cyt b进行了比较。采用测序法,获得鹿科6属动物dra第二外显子246 bp的序列。研究结果表明,多态性位点数18个,独立变异位点13个。mhc-dra第二外显子显示出较低的核苷酸变异,且6属有各自独特的变异位点。氨基酸序列中抗原结合位点共计20个。其中,鹿科6属动物的氨基酸位点63,驼鹿属氨基酸位点18,是不同于马属和人属的抗原结合位点,推测鹿科动物可能有着不同的抗原结合模式。根据非同义替代率(Ka)和同义替代率(Ks)比值的计算结果,表明鹿属mhc-dra第二外显子为正向选择,其余5属均为纯化选择。对mhc-dra第二外显子及cyt b分别运用邻接法(NJ),最大似然法(ML)和贝叶斯推论(BI)进行系统发育重建得到相似结果,形成了旧世界鹿类与新世界鹿类的姐妹类群。麂亚科cyt b和mhc-dra第二外显子的基因型可能是鹿亚科与其它亚科之间的过渡型,而气候变化和环境变迁可能是推动mhc-dra第二外显子分化的潜在原因。
由玉岩,张成林,张金国,阮向东,张林源,钟震宇,郑常明,刘学锋,王伟,曹长雷. 鹿科6属MHC-DRA第二外显子变异特点及与Cyt b系统进化比较[J]. 生物学杂志.
YOU Yu-yan,ZHANG Cheng-lin1,ZHANG Jin-guo,RUAN Xiang-dong,ZHANG Lin-yuan,ZHONG Zhen-yu,ZHENG Chang-ming,LIU Xue-feng, WANG Wei,CAO Chang-lei. Variation characteristic of MHC-DRA exon 2 in six deer genera of family Cervidae and phylogenetic evolution compared with Cyt b[J]. .