南海新村湾海草沉积物细菌群落组成及分布
- 1. 中国科学院南海海洋研究所 热带海洋生物资源与生态重点实验室, 广州 510301；
2. 中国科学院大学, 北京 100049； 3. 中国科学院海南热带海洋生物重点实验站, 三亚 572000
The bacterial communities constitution and distribution in sediment of seagrass in Xincun Bay, South China Sea
- 1. Key Laboratory of Tropical Marine Bio-Resources and Ecology, South China Sea Institute of Oceanology，CAS, Guangzhou 510301; 2.University of Chinese Academy of Sciences， Beijing 100039;3.National Experiment Station of Tropical Marine Biology， Sanya 572000， China
摘要： 采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术及产物序列分析方法，比较研究南海新村湾3个站位海草沉积物中细菌群落组成及分布。结果表明：根据DGGE图谱代表的遗传多样性显示春季二号和春季三号站位样品相似度最高为81.5%，秋季一号和秋季三号站位样品相似度最低为29.3%。春季和冬季细菌多样性指数较高，其Shannon 指数范围分别为3.03~3.07和3.23~3.35。通过对16S rDNA V3 高变区域42条条带克隆测序比对，结果显示：海草沉积物细菌类群主要分布在变形菌门（Proteobactetia）和厚壁菌门（Firmicutes），其中变形菌门中Gammaproteobacteria含量最多，为新村湾海草沉积物中优势菌群，占总数的65.80%。蓝细菌（Cyanobacteria）普遍存在于所有沉积物样品中。细菌群落结构在不同季节、不同站位间具有一定差异。秋季二号站位和三号站位优势类群分别为嗜冷杆菌属和交替假单胞属，其含量分别为31.61%和19.41%。