生物学杂志

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黄酮3-羟化酶(F3H)的生物信息学分析

  

  1. 西南交通大学生命科学与工程学院,成都 610031
  • 出版日期:2015-12-18 发布日期:2015-12-18
  • 通讯作者: 李 萍,教授,博士,研究方向为生物化学与分子生物学
  • 作者简介:王若曦,大学本科,研究方向为植物酶
  • 基金资助:
    国家自然科学基金Ti基材料表面抗凝/诱导内皮双功能修饰层构建、评价及双功能竞争与平衡的分子机制(31170916)

  1. School of Life Science and Engineering, Southwest Jiaotong University, Chengdu 610031 , China
  • Online:2015-12-18 Published:2015-12-18

摘要: 通过生物信息学分析方法,对已经在GenBank上注册的青稞(Hordeum vulgare)、高粱(Sorghum bicolor)、小麦(Triticum aestivum)、玉米(Zea mays)、洋葱(Allium cepa)、花烛(Anthurium andraeanum)和美丽百合(Lilium speciosum)等7种单子叶植物的F3H核酸以及相应氨基酸序列进行研究,并对其组成成分、理化性质、信号肽、亚细胞定位、跨膜结构、蛋白质二级、三级结构、结构域以及分子进化等方面进行分析与预测。研究结果表明,除玉米F3H蛋白定位于过氧化物酶体外,其他植物F3H均定位于细胞质基质内;所有植物F3H均为不含信号肽的非分泌型蛋白,且没有跨膜区域的亲水性蛋白;α-螺旋和无规则卷曲是F3H的主要二级结构元件,而延伸链则散布于整个蛋白中;F3H拥有一个2OG-Fell Oxy super family和一个PLNO3176 super family保守结构域;所构建的F3H系统发育进化关系与形态学上物种发育关系基本吻合。

Abstract: Bioinformatics analysis of flavanone-3-hydroxylase(F3H)