生物学杂志 ›› 2022, Vol. 39 ›› Issue (5): 13-.doi: 10.3969/j.issn.2095-1736.2022.05.013
摘要: 使用基因表达数据库(gene expression ominibus, GEO)芯片数据GSE161731,利用差异表达分析、Lasso回归等方法,筛选区分早期COVID-19患者的关键基因,应用ROC曲线评价关键基因的早期COVID-19患者诊断准确性。基于权重基因共表达网络分析(WGCNA)构建的共表达网络,筛选出不同疾病组对应的关键基因。KEGG富集分析用于阐释基因模块的功能和相关信号通路。共获得509个差异基因,并初步筛选出17种早期COVID-19患者潜在诊断标志物,包括YBL2、PKMYT1、HJURP、TCN2、TTC24、ESPL1、GZMK、RPA3、ATP5F1E、CD2、ZAP70、IL15RA、NFYB、CIAO2A、PLRG1、GPATCH11和MRPL33。KEGG结果显示差异基因主要与细胞周期、T细胞免疫、氧化磷酸化有关。WGCNA分析确定的COVID-19特异性基因模块,主要参与核糖体蛋白的合成、氧化磷酸化等生理活动。
中图分类号: